Metodika hodnocení výsledků výzkumu a vývoje (později metodika hodnocení výsledků výzkumných organizací) používaná v ČR prošla od roku 2004 celou řadou změn, které ale neměnily podstatu původně ne příliš vhodně nastaveného systému. Deformace, které takové hodnocení přinášelo, se plně projevilo v okamžiku, kdy na výsledky hodnocení bylo bezprostředně navázáno rozdělování prostředků na dlouhodobý koncepční rozvoj výzkumné organizace. Diskuse v odborné komunitě o dalším směřování metodiky hodnocení, negativní efekty jejího působení ve výzkumných organizacích, (v té době) dílčí výstupy Mezinárodního auditu systému VaVaI v ČR vedly v roce 2011 Radu pro výzkum, vývoj a inovace k přijetí Dlouhodobých principů hodnocení výsledků výzkumných organizací. Tyto principy v zásadě naplňuje projekt IPn Metodika, který by měl vědecké komunitě i státní správě přinést metodiku hodnocení výzkumných organizací, ale i systému výzkumu a vývoje v ČR respektující mezinárodní standardy a oborové odlišnosti a vycházející z kvantitativních i kvalitativních kritérií.

Since 2004 the methodology of evaluating research and development results (later: methodology of evaluating results achieved by research institutions) applied in the Czech Republic has gone through many revisions which however have not changed the principles of what was devised as a not very suitable system. The deformations resulting from such evaluation became fully apparent when the results were directly linked to the distribution of funds provided for the long term development of a given organisation. In 2011 the Council for Research, Development and Innovation decided on the basis of discussions within expert community about the fate of evaluation methodology, negative effects it had on research institutions, partial outputs (at that time) of the RDI System International Audit in the Czech Republic to adopt the Long Term Principles of Evaluating the Research Institutions Results. These principles are the backbone of IPn Methodology Project that should provide the scientific community as well as the public administration with an instrument of evaluating research institutions and with the system of research and development in the Czech Republic respecting international standards and departmental differences, based on quantitative and qualitative criteria