Systém financování výzkumných institucí z veřejných prostředků v České republice prošel od r. 1990 složitým vývojem a zejména v posledním desetiletí dospěl do velmi neuspokojivého stavu. Rozhodování o tom komu a v jaké výši přidělit institucionální podporu pro výzkum a vývoj postrádá strategické informace. Opírá se o pouhé mechanické sledování výstupů s pravidly měnícími se z roku na rok. Hrubé nedostatky rozhodovacího systému jsou kompenzovány nesystémovými opatřeními. Jedním z hlavních cílů individuálního projektu národního „Efektivní systém hodnocení a financování VaVaI“ je navrhnout mechanismy efektivního financování výzkumných institucí z veřejných prostředků, které se budou opírat o nový systém hodnocení výzkumných organizací, budou klást důraz na excelenci, motivaci a střednědobou stabilitu.

The system of funding research institutions from public resources in the Czech Republic has undergone a complicated development since 1990 and, particularly during the last decade, arrived at a very unsatisfactory state. The decision process about which organisations should receive institutional support for R&D, and at which level, lacks strategic information. It relies on mere mechanical recording of outputs, with the rules changing every year, and ad hoc measures must then compensate for serious flaws. One of the main goals of the Individual National Project “Effective Evaluation and Financing System for Research, Development and Innovation” is to propose mechanisms for effective public funding of research institutions based on a new evaluation system and emphasizing excellence, motivation and medium-term stability.